Den ligger i Indalsälvens vattensystem och är till ytan Sveriges femte största sjö. Storsjön är även landets fjärde största regleringsmagasin med en reglerbar volym på 1,25 kubikkilometer, samt den största sjön inom ett enda län. Enligt vattendom får nivån variera mellan ,50 och ,25 m ö.
Volymen motsvarar en tappning över året på 17,3 meter vilket är detsamma som Storsjöns medeldjup. Omsättningshastigheten därmed brukligt beskrivet som en gång per år. Det kan jämföras med Vätterns med en gång på 60 år varför Storsjön kan betraktas som relativt okänslig för föroreningar.
Storsjön ligger i ett med norrländska mått tätbefolkat område som kallas för Storsjöbygdenen kulturbygd som också är bördig för jordbruk. Trots detta är sjön mycket näringsfattig och den har Vattenrelaterat klarat sig bra från föroreningar, och vattnet är således klart och ganska rent.
Den kalkrika jordmånen ger även sjön ett naturligt försvar mot försurning. Sjön grenar sig i flera långsträckta och breda vikar som MyrvikenBergsvikenBrunfloviken och så vidare. Storsjön har också många olika sund som ÖstersundetVallsundetSannsundet och Rödösundet.
Storsjöbygden och Storsjön beskrivs ibland som en oas i vildmarkenomgiven av höga fjäll i väster och stora skogsområden i öster. Enligt sägnen lever det mytomspunna Storsjöodjuret i sjön. Båttrafiken på Storsjön är utbredd och sjön används även i stor omfattning till rekreation och fiskesåväl på vintern som på sommaren.
Som en av de största sjöarna i Sverige är det fritt att fiska med handredskap. Storsjön är en av fyra svenska sjöar som har allmänt vatten. Namnet Storsjön betyder "den stora sjön". Många öar och bygder runt Storsjön har sakrala namn, även om några som till exempel Andersön Ondursöy, alltså Skadesö har förvanskats och Frösön Frejs ö och Odensala.
Storsjöns namn förefaller livlöst i jämförelse med alla genuina ort- och sjönamn i dess närhet. Därför har namnet tolkats som ett kristet ersättningsnamn för ett äldre, okänt, fornnordiskt namn [ 3 ]. En del av Storsjön bär namnet Åssjön och detta namn skulle enligt vissa vara det som ersattes.
Förleden Ås- härleds då från det norröna áss med omstridd betydelse, vanligtvis gudvilket skulle ge "Åssjön" betydelsen asa gudarnas heliga sjö [ 4 ]. De enda större öarna är Åsön, ett före detta övningsmål för F4-flottiljen på Frösön, samt Gåjeholmen.
Den södra delen av Storsjön kallas för Södra Storsjöflaket. Avlagringar i Storsjöns och dess närområdes berggrund är bland annat kalkstensvart alunskiffer och lerskiffer. Enligt vissa forskare härrör dessa från ett runt miljoner år gammalt tropiskt hav.